document_id: "UA-ANPC-A08" series: "AI-Native Preprint Commons Series" series_part: 8 version: "0.1" language: "zh-Hant" title: "Source Is Canonical:Markdown、EveGlyph 與後 PDF 時代的 AI 原生學術文件" english_title: "Source Is Canonical: Markdown, EveGlyph, and AI-Native Scholarly Documents Beyond the PDF-Centric Era" author: - "Neo.K" - "Aletheia / GPT-5.6 Sol — research and drafting collaborator" institution: "EveMissLab/一言諾科技有限公司" status: "architecture / scholarly-document infrastructure paper" date: "2026-09-03" canonical_source: "UTF-8 Markdown" license_note: "This paper is intended for open academic publication within the Unbounded Axiom research ecosystem."
Source Is Canonical
Markdown、EveGlyph 與後 PDF 時代的 AI 原生學術文件
AI-Native Preprint Commons Series — Paper 08
摘要
傳統電子學術出版長期以 PDF 作為主要閱讀與保存介面,部分領域則要求作者透過 LaTeX、Word 或其他文書系統產生 PDF。這種工作流在人類視覺閱讀與紙本出版時代具有高度實用性,但在 AI 原生研究環境中產生新的結構性摩擦:AI 先生成具有語義結構的文字、公式、引用與資料,再被壓平為 PDF;後續 AI 若要搜尋、驗證、引用、重組或進行 claim-level reasoning,又必須重新解析版面、恢復段落、公式與 citation relations。研究物件因此反覆經歷結構化、降維、再重建。
本文提出 Source-Native Scholarly Document Architecture(SNSDA),作為 Unbounded Axiom AI-native preprint commons 的文件基礎層。其核心原則為:
但本文進一步修正「canonical source」的範圍,將學術文件分為三個互相連結、不可互相偷換的層:
Author Canonical Source(ACS) 是作者實際提交、確認與版本化的 UTF-8 Markdown 或純文字來源;它保存原始措辭、公式、段落、引用與作者意圖,不得被 renderer 或 AI preprocessing 靜默改寫。Platform Canonical Research Object(PCRO) 則是平台經 schema validation、author confirmation 與 provenance-preserving compilation 後形成的 addressable research-object graph,可包含 claim、definition、equation、citation、dataset、figure、proof、code、research metadata、evidence relations 與 version lineage。未來 EveGlyph ASCS / EGIR 類架構可以承擔此層。PDF、HTML、mobile view、print view、JATS XML、MathML、SVG、PNG、interactive chart、API JSON 與 graph view 都屬於 Rendered / Interchange Projections。
本文主張 Unbounded Axiom 的投稿首選格式應是 UTF-8 Markdown,並接受 UTF-8 純文字。投稿者不必先學完整 LaTeX document workflow,也不必自行生成 PDF。數學內容仍可使用熟悉的 LaTeX-style math syntax,例如 $...$ 與 $$...$$;這是 mathematical serialization,而不是要求作者使用 LaTeX document authoring system。純文字輸入則可由 deterministic parser 與可選 AI preprocessing 產生 normalized candidate,但原始 raw_submission.txt 必須保存,且任何語義性修改必須可見、可接受或可拒絕。
本文亦提出 scholarly rendering 的可重現性要求。對 source 、publication profile 、renderer version 與 options ,出版 artifact 應表示為:
並至少保存 source hash、artifact hash、renderer version、profile version、warnings 與 artifact metadata。Renderer 不得為了排版方便偷偷執行:
若需要修復 source,必須進入獨立的 patch / review / commit 流程。
外部學術標準不需被排斥。JATS 1.4 仍是成熟的 journal-article XML interchange standard;MathML Core 提供 browser-oriented mathematical markup;HTML、SVG 與 PDF 各有不可替代的展示與交換價值。SNSDA 的立場不是「所有人只能用 Markdown」,而是:
因此 PDF 不會消失。它仍然適合下載、列印、存檔、引用頁碼與傳統出版交換。但在 AI-native preprint platform 中,它應由 canonical source / research object 生成,而不是反過來成為機器唯一能取得的研究真源。
關鍵詞: Markdown、UTF-8、EveGlyph、ASCS、EGIR、PDF、JATS、MathML、Canonical Source、Scholarly Document、AI-native Publishing、Unbounded Axiom
1. 問題:我們為什麼還在把結構化研究壓成 PDF,再叫 AI 解析回來?
考慮今日常見流程:
另一個 AI 想讀時:
也就是:
這在 AI-native infrastructure 中是一種不必要的往返。
2. PDF 很成功,但成功於另一個問題
PDF 很擅長:
- 保留視覺版面;
- 跨裝置呈現;
- 列印;
- 頁碼;
- 圖文固定配置;
- 傳統出版;
- 長期靜態 artifact;
- 文件交換。
所以本文不是反 PDF。
真正問題是:
PDF 是否應該是研究物件唯一的 canonical representation?
本文答案是:
3. Visual Fidelity 與 Semantic Fidelity 是兩種 Fidelity
PDF 優先保留:
AI-native research object 還需要:
例如 PDF 可以把:
Theorem 3
顯示得非常漂亮。
但若沒有結構資訊,AI 未必知道:
object_type: theorem
object_id: theorem-3
depends_on: lemma-7
validation_state: proof-checked
因此:
4. Source-Native Scholarly Document Architecture
本文提出:
SNSDA — Source-Native Scholarly Document Architecture
其三層為:
其中:
- :Author Canonical Source;
- :Platform Canonical Research Object;
- :render / interchange artifacts。
5. Author Canonical Source
Author Canonical Source(ACS) 回答:
作者到底提交了什麼?
對 Unbounded Axiom v0.x,首選:
UTF-8 Markdown
以及:
UTF-8 plain text
6. 為什麼一定要保留作者原始 Source
如果平台只保存 AI normalization 後的版本:
然後刪掉:
未來就無法回答:
這句話原本是不是作者寫的?
因此:
7. Raw Submission 不一定等於 Published Canonical Edition
作者可能提交:
raw_submission.md
經確認後產生:
canonical_v1.md
兩者關係:
關鍵是 transformation 可追蹤。
8. Normalization 不得是 Silent Rewrite
合法 normalization:
- line ending;
- UTF-8 normalization policy;
- heading syntax repair;
- table delimiter repair;
- metadata mapping;
- math delimiter normalization;
- whitespace;
- stable object anchors。
如果改變:
- claim;
- number;
- theorem;
- causal wording;
- conclusion;
- limitation;
就不是 formatting normalization。
9. Semantic Delta Gate
定義:
若:
可進 automatic formatting class。
若:
必須:
AUTHOR_VISIBLE_REVIEW
或相應 authorized research review。
10. Markdown 是 Authoring Surface,不必是終極 Ontology
這是 SNSDA 與 ASCS 的重要相容點。
目前 EveGlyph Editor 使用 Markdown file 作 primary editable source。
未來 ASCS 則可以將其 import 成:
因此:
不必宣稱:
11. Platform Canonical Research Object
平台需要一個比線性 Markdown 更適合 AI query 的 structured layer。
本文定義:
其中:
- :addressable nodes;
- :typed relations;
- :metadata;
- :version / lineage;
- :provenance。
12. Addressable Nodes
可包括:
section
paragraph
definition
claim
hypothesis
conjecture
theorem-claim
proof
equation
citation
evidence
dataset
table
figure
chart
code
experiment
method
limitation
revision-note
13. 同一篇 Paper 不再只是 Byte String
傳統:
未來:
其中:
保存 object relations。
14. Claim-Level Addressing
例如:
ua:paper:5001#claim-17
可以被:
citation
validation
comment
replication
revision
直接指向。
15. Equation-Level Addressing
例如:
ua:paper:5001#eq-14
可連到:
derived-from
used-by-proof
validated-by
computed-by
16. Dataset-Level Addressing
ua:paper:5001#dataset-2
可連 Paper 04 SREPA:
17. Figure 也應是 Object
不是只存:
figure3.png
而是:
figure:
id: figure-3
kind: data-visualization
data_refs:
- dataset-2
plot_spec:
renderer:
artifact_refs:
- figure3.svg
- figure3.png
18. Code Block 也應有 Identity
一段可執行 code 可以保存:
language
environment
dependencies
input refs
output refs
hash
execution state
而不是只是一塊 syntax-highlighted text。
19. ASCS 的定位
EveGlyph Addressable Symbolic Computational Space 的核心方向是:
SNSDA 不要求預印本平台第一天就完整實作 ASCS。
但 paper schema 應該不阻止這個方向。
20. 兩種 Canonicality 必須命名清楚
本文提出:
20.1 Authorial Canonicality
哪一份文字是作者確認的正式版本?
20.2 Semantic / Platform Canonicality
哪一份 structured object graph 是平台目前認可的 canonical machine representation?
21. 兩者不必互相消滅
兩者由 deterministic / reviewed mapping 連接。
22. Source–Object Mapping
每個 machine object 應能回指 source span:
source file
start line
end line
source hash
parser version
mapping version
23. Machine Object 不能憑空出現
若 AI inference 新建:
claim-17
但 source 沒有相應表述,
應標:
INFERRED_OBJECT
而不是:
AUTHOR_DECLARED_OBJECT
24. Source Authority 與 AI Interpretation 分離
這與 Paper 04:
一致。
25. Markdown 投稿:最適合 2026 的人機共同介面
Markdown 的優勢:
- plain text;
- git-friendly;
- diff-friendly;
- AI-friendly;
- human-readable;
- web-friendly;
- formula embedding;
- code embedding;
- lightweight metadata;
- ecosystem large;
- easy UTF-8 storage。
26. Markdown 的價值不是「語法比較潮」
而是:
27. 投稿者不必學 Document-Class Engineering
如果研究者只想寫研究:
不應要求先處理:
documentclass
package conflicts
font package
page geometry
bibliography backend
compilation engine
28. LaTeX Math 與 LaTeX Document Workflow 分離
Unbounded Axiom 可以保留:
例如:
$...$
與:
$$...$$
但不要求:
\documentclass{article}
...
\begin{document}
...
\end{document}
29. 核心分離
30. 為什麼 $...$ / $$...$$ 很實用
它們:
- 對人類簡潔;
- 對 AI 熟悉;
- 對 Markdown ecosystem 常見;
- 易轉 KaTeX / MathJax;
- 可轉 MathML;
- 可進 native math parser。
W3C MathML Core 甚至在說明中對應 TeX inline / display mode 與 MathML inline / block display。
31. 但 LaTeX String 不必成為永遠的 Math Canonicality
ASCS 長期可以:
因此 LaTeX 可以是 authoring serialization。
32. Native Math Object
可保存:
operator
operands
binder
assumptions
units
constraints
exactness
proof relation
computation provenance
這比一條純字串更適合 computation。
33. KaTeX / MathJax 是 Renderer,不是 Mathematical Truth
公式顯示成功:
公式語義合法。
因此:
34. MathML 的 Interchange 角色
MathML Core 定義適合 browser implementation 的數學 markup subset,目標是讓數學像 text 一樣能在 Web 被傳送、接收與處理。
因此:
MathML
非常適合:
- web projection;
- accessibility;
- interchange。
35. JATS 的 Interchange 角色
JATS 1.4 是 ANSI/NISO Z39.96-2024。
它提供:
publisher / archive 交換 scholarly journal article content 的 common XML format。
因此 SNSDA 不應重新發明:
外部 publisher XML interchange。
可以 export:
36. JATS 不必成為 Authoring Requirement
外部 publisher 喜歡 XML:
不代表作者要手寫 XML。
因此:
37. TXT 投稿
如果使用者完全不想寫 Markdown:
平台應接受:
UTF-8 .txt
38. TXT 的 Pipeline
39. Raw TXT 永久保留
raw_submission.txt
不能被 normalization 覆蓋。
40. TXT Parser 可以做什麼
deterministic:
- blank-line paragraph detection;
- obvious numbered headings;
- reference patterns;
- code fences where explicit;
- URL / DOI detection;
- common math delimiters。
AI optional:
- ambiguous heading;
- table reconstruction;
- equation-vs-text classification;
- bibliography boundary;
- malformed structures。
41. AI Parser 的輸出只是 Candidate
不能直接變 canonical。
42. AI Repair 不得偷偷寫 Content
如果 AI 認為:
這段應改寫比較學術。
那是:
editorial suggestion
不是:
render fix
43. Render Repair 與 Editorial Rewrite 分離
RENDER_REPAIR
STRUCTURAL_NORMALIZATION
EDITORIAL_SUGGESTION
SEMANTIC_CHANGE
四類要分。
44. Markdown Frontmatter
可以有最小:
---
schema: "ua-preprint/1.0"
title: "..."
language: "zh-Hant"
work_id: "..."
version: "1.0"
---
45. 作者不必手填所有 Metadata
Paper 02–07 已經有大量:
- research classification;
- evidence;
- source;
- identity;
- privacy;
- economic;
metadata。
不應要求作者手刻 300 行 YAML。
46. Metadata 來源可以是:
author declared
form input
AI proposed
platform inferred
external registry
validator
並保留 provenance。
47. Human Form 與 Markdown Frontmatter 只是不同 UI
兩者最後進:
48. Submission Object
定義:
其中:
- :raw upload;
- :author-confirmed canonical source;
- :structured research object;
- :artifacts;
- :history。
49. Hash
至少:
50. Structured Object Hash
若 EGIR / canonical JSON 有 deterministic canonicalization:
51. Artifact Hash
每個:
保存:
52. Render Function
EveGlyph Publication Runtime 已提出:
本文一般化:
53. Renderer 不得反向修改 Source
禁止:
除非明確產生:
patch proposal
54. Layout Fix 應該改 Publication Profile
如果表格太寬:
錯誤做法:
偷改原論文內容。
正確:
responsive table
landscape projection
font scaling
overflow handling
print profile
55. Publication Profile
例如:
ua-web-v1
ua-mobile-v1
ua-print-v1
ua-pdf-academic-v1
ua-accessible-v1
ua-jats-export-v1
56. 同一 Source 多 View
但 scholarly meaning 應保持。
57. Artifact Equivalence
不要求 byte-identical。
例如:
- web HTML;
- PDF;
- mobile HTML;
本來不同。
需要的是:
58. Fidelity Report
每個 export 可標:
lossless semantic
layout-only difference
math fidelity preserved
interactive feature flattened
private fields omitted
unsupported object degraded
59. PDF 的正確定位
SNSDA 將 PDF 定義為:
60. PDF 還是非常重要
用途:
- download;
- print;
- archival snapshot;
- page citation;
- offline reading;
- publisher exchange;
- fixed visual record。
61. 但 PDF 不是唯一 Research State
PDF 看不到:
- hidden claim graph;
- validation state;
- source health;
- private/public projection metadata;
- structured dataset relation;
- interactive chart spec;
- agent execution provenance。
62. 因此:
63. HTML 的定位
可以支援:
- responsive layout;
- anchors;
- dynamic citation status;
- interactive chart;
- accessibility;
- semantic metadata。
64. API / JSON 的定位
供 AI:
- query;
- retrieval;
- graph traversal;
- validation;
- research continuation。
65. Graph View
可顯示:
claim
evidence
citation
revision
author
dataset
關係。
66. Mobile View
不應只是 PDF 縮小。
可以重新流式排版。
這就是 projection 的價值。
67. Print View
可以:
- fixed page size;
- stable headings;
- table pagination;
- footnotes;
- page numbers。
不需要污染 source。
68. Accessibility View
可以加入:
- semantic headings;
- alt text;
- MathML;
- ARIA;
- table summaries;
- figure descriptions。
69. Bilingual Projection
一個 work:
可有:
zh-Hant edition
English edition
70. Translation 不是另一個 Work
若語義不變:
只是 editions。
71. Translation 改變理論時
如果英譯過程改了:
- theorem;
- definition;
- scope;
- claim;
則:
應升級 work version。
72. Machine Semantic Layer 可以獨立存在
未來:
Human zh-Hant
Human English
Machine Semantic Object Graph
三者可以共同指向同一 work。
73. Figure 種類要 Typed
Paper 04 已區分 evidence provenance。
本文建議:
AUTHOR_FIGURE
AI_REFORMATTED_FIGURE
AI_DERIVED_DATA_VISUALIZATION
AI_ILLUSTRATIVE_DIAGRAM
EXTERNAL_FIGURE
74. AI Illustrative Diagram
概念圖:
empirical evidence。
UI 應標明:
Illustrative
75. AI Derived Data Visualization
必須有:
76. Chart 不應先 Flatten 成 PNG
canonical 可以保存:
chart type
x
y
data ref
transform
labels
units
renderer
77. 再輸出:
interactive web
SVG
PNG
PDF
78. SVG 的價值
對 diagram / chart:
- vector;
- searchable text;
- scalable;
- web native。
79. PNG/JPEG 的定位
適合:
- photos;
- raster evidence;
- screenshots;
- compatibility。
但不是 structured chart 的理想唯一 source。
80. Table 也不應只是 Image
應保持:
rows
columns
header semantics
units
source refs
81. Data Table → Multiple Projection
82. Citation Display 也只是 Projection
source edge:
可以 render 成:
- numeric citation;
- author-year;
- footnote;
- inline source card;
- machine link。
83. Bibliography Style 不應改 Citation Semantics
84. Page Numbers 是 Projection-Specific Locator
PDF:
page 17
HTML:
#claim-17
Source:
lines 300-320
都可以指同一 object。
85. Stable Object ID 比 Page Number 更跨格式
因此:
在 machine interoperability 上更強。
86. Page Number 仍應保留
因人類仍習慣:
p. 17.
所以 PDF artifact 可以提供 page-map:
claim-17 -> page 17
87. Code Execution Artifact
對可執行 paper:
code block
execution environment
output
logs
hash
可以是 PCRO object。
88. Jupyter 的啟示
Notebook 已經證明:
narrative + code + output
可以共存。
但 SNSDA 不要求所有論文都 notebook 化。
89. Narrative / Execution 分離仍重要
一個 code block:
execution result。
要保存:
source code
execution event
output
三者。
90. Native Execution 是未來能力,不是投稿前置
普通作者上傳 Markdown:
不需要寫 executable document。
平台可逐步增強。
91. EveGlyph Editor 的當前角色
目前可定位為:
提供:
- Markdown workspace;
- live preview;
- KaTeX;
- metadata;
- AI agent;
- git snapshot / diff review;
- encoding-aware IO。
92. EveGlyph Publication Runtime 的角色
所有入口:
Editor
CLI
Batch
MCP
API
Agent
應共用同一 renderer。
93. ASCS / EGIR 的角色
長期接:
- addressable object;
- native math;
- symbol IR;
- execution;
- lineage;
- provenance。
94. 三者不是重複產品
可以形成:
95. Unbounded Axiom 的角色
96. 投稿入口可以很簡單
Upload Markdown
Paste Text
Agent / API Submit
97. 不應要求:
Upload PDF only
作為唯一正式入口。
98. PDF Import 可以是 Compatibility Path
既有研究只有 PDF:
平台可以 ingest。
但標記:
SOURCE_RECOVERED_FROM_PDF
99. PDF-derived Source 不等於 Author Canonical Source
因為可能:
- OCR error; -formula loss; -order ambiguity; -footnote mix; -table corruption。
所以:
100. Legacy Word / LaTeX Import
也可以:
.docx
.tex
作為 adapters。
但平台 public submission 不必要求這些。
101. LaTeX Import
.tex 可以保留:
raw source
再 map:
102. Word Import
.docx 可作 legacy source。
但 native future workflow 仍優先 text-first。
103. JATS Import / Export
對 publisher interoperability:
可逐步支援。
104. CommonMark 與 Markdown Dialect
Markdown ecosystem 不只有一種 dialect。
因此平台應定義:
ua-markdown/1.0
而不是:
隨便哪個 Markdown 都猜。
105. UA Markdown Profile
可以基於 CommonMark 思想,加入:
frontmatter
math
citations
object anchors
figure metadata
research extensions
106. Unknown Markdown Extensions
遇到未知 extension:
應:
preserve raw syntax
warn
fallback render
而不是靜默刪掉。
107. Parser Version
source mapping 必須保存:
parser_version
profile_version
因 parser 會變。
108. Parser Upgrade 不能默默改歷史
新 parser:
解析舊 source 可能產生不同 object graph。
應:
reparse candidate
diff
review
commit
109. Structural Regression Corpus
平台應建立:
Markdown torture corpus
包含:
- 中文;
- 中英混排;
- 公式;
- 表格;
- code;
- long heading;
- nested list;
- unicode;
- broken syntax;
- long equations;
- citations;
- images。
110. 你的既有 Corpus 是天然 Regression Dataset
數千篇中文研究:
可以作:
111. Renderer 成熟度
不是:
Demo 看起來漂亮。
而是:
112. Render Evidence
每次至少:
source hash
artifact hash
renderer version
profile version
warnings
page count
timestamp
113. Render Report
可再加:
unsupported features
fallbacks
math failures
image failures
table overflow
font substitutions
accessibility warnings
114. Artifact Provenance
115. Re-render
同一 source / profile / renderer:
應能產生 reproducible artifact 或 declared-equivalent artifact。
116. Byte Reproducibility 與 Visual Reproducibility 分離
PDF metadata timestamp 可能改 bytes。
所以可分:
BYTE_IDENTICAL
STRUCTURALLY_EQUIVALENT
VISUALLY_EQUIVALENT
SEMANTICALLY_EQUIVALENT
117. Render Reproducibility 不證明 Research Truth
它只證明 publication pipeline 穩定。
118. Source Validation 不證明 Claim Truth
UTF-8 valid:
theorem valid。
不同層各自驗證。
119. UTF-8 Canonical Source
正式 source 必須:
- valid UTF-8;
- no lossy replacement;
- stable newline policy;
- hashable;
- versioned。
120. Encoding Adapter
legacy Big5 / Shift-JIS / GBK 可 import。
但:
121. Import Provenance
original encoding
decoder
errors
normalization
output hash
要保存。
122. Unicode Normalization
若平台做 NFC / NFKC 等 normalization:
必須明確。
尤其數學 / custom glyph 不可亂 normalize。
123. Custom Glyph
ASCS 長期允許:
不依賴 Unicode code point 的 symbol identity。
因此:
124. Glyph Projection
可 render:
- font;
- SVG;
- canvas;
- raster fallback。
125. Semantic Glyph Binding
symbol:
可以綁定:
meaning
operator
behavior
version
但 renderer 只顯示外觀。
126. Image Alt Text
AI 可以幫忙生成。
但:
AI-generated alt text
應標 provenance。
作者可修正。
127. Academic Figure Enhancement
未來 AI 可以建議:
- flowchart;
- taxonomy;
- comparison table;
- time series;
- dependency graph。
但都應形成 candidate object。
128. Visualization 不可創造假 Data
如果來源沒有數據:
AI 不得為了圖好看 invent:
42%
68%
91%
129. Illustrative Values
如必須使用示意數值:
必須標:
ILLUSTRATIVE
NOT MEASURED
130. Cognitive Compression
圖表的真正價值:
而不是:
讓 paper 看起來比較像 paper。
131. Representation Selection
AI 可以估:
paragraph → keep text
taxonomy → tree
comparison → table
time series → line chart
process → flow diagram
dependency → graph
132. 但 Author Controls Semantic Acceptance
representation change 若只改 view:
可 automatic。
若 summary / compression 遺失 material nuance:
需要 review。
133. Loss Budget
可定:
對不同 projection 有不同允許 loss。
134. Machine View 可以比 Human View 更完整
public web article 可能顯示:
- abstract;
- paper;
- figures。
machine API 還可提供:
- claim graph;
- evidence graph;
- version;
- source health;
- researcher IDs。
135. Human View 不應因 Machine Layer 變得難讀
AI-native 不等於:
把 JSON dump 給人。
UI 應做 projection。
136. Machine Layer 不應因 Human UI 變得貧乏
反過來也成立。
137. Source-Native = Multi-Projection
138. Versioning
Paper:
每版保存:
source hash
object graph hash
artifact set
change summary
revision reason
139. Diff
至少分:
TEXT_DIFF
STRUCTURE_DIFF
SEMANTIC_OBJECT_DIFF
METADATA_DIFF
RENDER_DIFF
140. Formatting Change 不必提升 Research Version
如果只改 PDF typography:
research work version 可不變。
artifact profile version 更新。
141. Claim Change 必須提升 Research Version
例如:
causal
改:
correlational
這是 semantic revision。
142. Translation Change 也可能需要 Work Revision
如果翻譯修正改變 claim strength:
需要。
143. Renderer Upgrade 不應改 Work Version
如果 source / semantics 不變:
只產生新 artifact revision。
144. Artifact History
可以有:
paper.pdf renderer-v1
paper.pdf renderer-v2
兩者對同一 work version。
145. Static Snapshot
正式 publication 可以 freeze:
publication artifact snapshot
供 citation。
146. Dynamic Web View
同一 paper 的 web UI 可以更新:
- source health;
- citation retraction badge;
- replication status。
不改原文。
147. Static Text 與 Dynamic Epistemic Overlay 分離
這是 AI-native preprint 的重要優勢。
148. 例如 Retraction Badge
Paper 04 發現 source retracted:
web 顯示:
Upstream source retracted — revalidation required
但原 paper source 保持。
149. PDF Snapshot 也可生成新 Overlay Edition
例如:
PDF generated 2026-09-03
之後生成:
PDF status-overlay 2027-01-02
原始 PDF 仍保留。
150. Canonical Research Object 與 Dynamic State
一些 state:
citation health
replication
validation
discussion
可能在 paper 發表後更新。
因此:
151. Research Record 是 Composite Object
其中:
- :work-version source;
- :structured object graph;
- :live epistemic state;
- :identity state references;
- :disclosure projection;
- :artifacts。
152. PDF 無法單獨承擔這個 Composite State
所以 PDF-only architecture 天然不足。
153. API Submission
AI 可以送:
canonical Markdown
metadata JSON
source manifest
evidence manifest
154. 最簡 API 也可只送 Text
平台再:
parse
classify
propose metadata
ask confirmation
155. Agent 不需要模擬 GUI 上傳
AI-native submission 應有 API / MCP。
156. Human 與 AI 使用同一 Research Object Schema
只是入口不同。
157. File Upload 仍然重要
人類喜歡:
drag and drop
保留。
158. Paste Text 也重要
甚至連 .md 都不想存:
直接貼。
159. Clipboard Submission
raw snapshot 仍建立:
submission.txt
並 hash。
160. No-LaTeX Barrier
投稿頁可以寫:
Markdown recommended. Plain UTF-8 text accepted. No LaTeX document preparation or PDF generation required.
161. 這不是反 LaTeX
LaTeX expert 仍可:
- upload
.texvia adapter; - use LaTeX math;
- export TeX;
- export PDF。
162. 只是把 LaTeX 從 Gate 變成 Option
而不是:
163. 學術門檻應該是 Research Integrity
投稿者真正應付出的成本是:
- claim clarity; -evidence; -source; -provenance; -validation; -limitations。
不是:
排版 skill test。
164. Epistemic Cost > Typesetting Cost
165. JATS 與傳統出版導出
平台如果未來需要投稿 journal:
再交 publisher。
166. LaTeX Export
數學 journal 需要:
167. DOCX Export
某些 institution 需要:
168. 格式要求應由 Export Adapter 承擔
不是作者重新打一份。
169. External Publisher Projection
Paper 05 已提出 canonical research record → publisher projection。
Paper 08 把 document format 也納入同一思想。
170. Publisher-Specific Styling
例如:
Nature-like export
IEEE-like export
journal-X export
應改 profile。
171. 不要讓作者 fork 內容只為排版
避免:
paper_final.md
paper_final_journal.md
paper_final_journal2.md
paper_really_final.md
(笑)
172. One Source, Many Export Profiles
173. Publication Profile 可版本化
ieee-export-v1
ieee-export-v2
174. Unsupported Publisher Requirement
若無法 losslessly export:
report:
MANUAL_INTERVENTION_REQUIRED
而不是 silent loss。
175. AI 可以幫忙 Export 修復
但修改 canonical source 需要 explicit review。
176. Source-Native Archive
長期 archive 至少保存:
canonical UTF-8 source
structured manifest / object graph
hashes
schemas
provenance
render profile
artifact snapshots
177. PDF Alone 不是最佳 Archive
因未來:
- parser; -screen reader; -AI; -new renderer;
都可能更需要 source。
178. Source Plainness 是長期優勢
UTF-8 plain text:
- implementation simple;
- inspectable;
- git-friendly;
- wide tool support。
179. Structured Object Graph 也要有 Portable Serialization
例如:
canonical JSON
JSONL
CBOR
未來可替換 physical format。
180. Semantic Identity ≠ Serialization
與 ASCS 原則一致。
181. ASCS 甚至可以讓 Canvas 只是 View
Canvas placement:
object ontology。
這避免 UI 成為 truth。
182. Chat Rendering 也不是 Source
非常重要:
不得從聊天畫面重新 copy 回正式論文,當作 canonical。
正式修改永遠對 source artifact。
183. Source Handoff
AI 接手時應讀:
canonical source
manifest
validation
history
而不是聊天截圖。
184. 這也是為什麼本系列輸出 .md
正式 paper 是 UTF-8 Markdown artifact。
聊天回答只是導航與摘要。
185. Source Validation Pipeline
186. Render Pipeline
187. Ingestion 與 Rendering 分離
parser 出問題:
renderer 出問題。
要不同 error class。
188. Parser Error
例如:
AMBIGUOUS_HEADING
BROKEN_TABLE
UNBALANCED_MATH
UNKNOWN_EXTENSION
189. Renderer Error
例如:
TABLE_OVERFLOW
FONT_FALLBACK
PAGE_BREAK_FAILURE
SVG_UNSUPPORTED
190. Semantic Error
例如:
CLAIM_MAPPING_CONFLICT
CITATION_UNRESOLVED
OBJECT_ID_COLLISION
191. AI Repair Routing
Paper 09 將處理:
192. Source-Native 與 AI Cost
deterministic valid Markdown:
這比每篇 PDF OCR / parsing 成本低。
193. 越多人投稿,Parser 可以越成熟
long-tail failure 被吸收到 rule。
AI basic repair rate:
194. Source-Native 也是成本架構
不是只有 document philosophy。
195. Security
Markdown / HTML import 仍需防:
- script injection;
- malicious links;
- resource fetch;
- path traversal;
- parser exploits。
196. Raw Source 不等於直接執行
code block:
automatic execution permission。
197. Executable Object 需要 Capability Gate
與 EveGlyph runtime:
proposal
candidate
commit
capability
一致。
198. External Resource Fetch
image URL / dataset link:
不應無條件由 renderer outbound fetch。
需要 controlled resolver。
199. Privacy Projection
Paper 06:
PRIVATE
RESTRICTED
PUBLIC
要在 rendering 前 filter。
200. 但 Private Object 不應被刪除 Canonical State
public renderer 只是 projection filter。
201. Economic Metadata Projection
Paper 07 的 agreement:
可能 private。
public paper只顯示:
funding disclosure
conflict
202. Researcher Projection
Paper 05 identity:
public:
publication name
researcher ID
private runtime detail可不顯示。
203. Multi-Layer Document
因此一篇 preprint 最終不是:
paper.pdf
而是:
204. Source-Native Scholarly Package
可以輸出:
paper.md
research.json
claims.jsonl
sources.jsonl
evidence.jsonl
authors.json
disclosure.json
render_manifest.json
paper.pdf
205. 不是每個下載者都需要全 Package
一般讀者:
HTML
PDF
AI researcher:
source + machine package
206. Compression / Bundle
可提供:
research-package.zip
但 canonical records 仍是版本化 objects。
207. Citation 其他 UA Paper
可以直接引用:
ua-work ID
claim ID
version
再 export 成 DOI / bibliography style。
208. 跨平台 Citation
外部 DOI 照 Paper 04。
209. Internal Scholarly Graph
UA papers 之間可形成高精度:
210. 這是 PDF-only 很難自然提供的能力
除非後處理再次抽取。
211. Annotation
讀者 comment 可指:
claim-17
而不是:
第 12 頁第三段大概那裡。
212. Revision Discussion
作者可以回:
claim-17 revised in v1.2
213. Replication
另一 paper:
replicates claim-17
214. Retraction
甚至只撤回:
claim-17
不一定整篇 paper。
215. Partial Retraction
這是 structured document 的另一優勢。
216. Paper-level Retraction 仍可保留
若核心崩潰:
RETRACTED
整 work status 改。
217. Source-Native Public Search
搜尋可以查:
definitions
theorem claims
datasets
methods
counterfactuals
limitations
而不是只有全文 keyword。
218. AI Retrieval
AI 可以取:
只給我 Paper X 的 definitions + open claims + source health。
節省 context。
219. Cognitive Context Efficiency
這與你一直在做的:
相容。
220. Source-Native 也能降低 Context Waste
不用每次餵整個 PDF。
221. Partial Materialization
222. 這與 EveGlyph Context Projection 相容
runtime 不把所有 object 無界塞進單次 context。
223. Structured Research Object 不等於 Knowledge Graph-only
仍保留完整 narrative source。
不要把 paper 只拆成 triples。
224. Narrative Matters
語境、論證順序、修辭與解釋仍有價值。
所以:
雙層共存。
225. 不要讓 Graph 吃掉 Source
structured extraction 可能錯。
source 是 authorial anchor。
226. 不要讓 Source 阻止 Structured Layer
相反也不能說:
有 Markdown 就夠了,不需要 object graph。
未來 AI-native research 需要兩者。
227. Dual Anchoring
這是 SNSDA 的核心修正。
228. Source Canonicality 的最小定義
229. Semantic Canonicality 的最小定義
230. Render Canonicality 不存在嗎?
可以有:
canonical publication artifact
例如正式 PDF snapshot。
但它只是:
不是 research source。
231. 三種 Canonical Scope
SOURCE_CANONICAL
SEMANTIC_CANONICAL
PROJECTION_CANONICAL
232. 這可以避免「canonical」一詞混亂
同一 work 可以同時有:
- canonical Markdown v1;
- canonical EGIR graph v1;
- canonical PDF snapshot v1;
但 scope 不同。
233. Conversion Fidelity
每次:
應有 fidelity class。
234. 示例
Markdown → HTML: semantic-lossless
Markdown → PDF: interaction-lossy
Native Math → LaTeX: semantic-partial
Interactive Chart → PNG: interaction-lossy
Private Research Object → Public HTML: intentionally-redacted
235. Loss 是合法的,只要有聲明
關鍵是不能假裝 lossless。
236. Fidelity Metadata
projection:
source:
profile:
fidelity:
omitted_objects:
degraded_objects:
warnings:
237. 外部標準相容策略
SNSDA 應採:
CommonMark-like Markdown profile
MathML adapter
JATS adapter
HTML
SVG
PDF
JSON / JSON-LD-like machine export
PROV mappings
DataCite metadata mappings
238. Interoperability ≠ Canonical Dependence
可以 export JATS。
不代表 internal ontology 必須等於 JATS。
239. External Standard Upgrade
JATS 1.4 → future 1.5:
更新 adapter。
不改 paper source。
240. MathML Upgrade
同理。
241. Renderer Independence
Publication Runtime 可以未來替換底層:
- browser;
- Typst;
- Paged.js;
- custom engine。
只要 contract 保持。
242. 但同一 Profile 必須有 Version
避免:
PDF 變了卻不知道為什麼。
243. EveGlyph Publication Runtime 的戰略位置
它不只是:
Markdown to PDF converter。
而是:
244. 更長期
245. Unbounded Axiom 可以成為它最大的真實 Corpus
不是 toy demo。
246. 5000 Papers 的價值
大量:
- 中文;
- 公式;
- 跨領域;
- 不同長度;
- 不同世代;
是 renderer / parser torture corpus。
247. Founder Corpus 轉成 Platform Test Corpus
這是轉型的一個額外好處。
248. Platform Learning
每次 edge case:
parser / renderer regression test。
Paper 09 接續。
249. Source-Native Scholarly Constitution
本文提出以下不變量。
Invariant 1
Invariant 2
Invariant 3
Invariant 4
Invariant 5
Invariant 6
not the sole research source.
Invariant 7
Invariant 8
Invariant 9
Invariant 10
Invariant 11
Invariant 12
250. 最小 Unbounded Axiom Submission v1
入口:
Upload .md
Upload .txt
Paste text
Agent/API
251. .md 路徑
raw.md
→ validate
→ normalize candidate
→ review
→ canonical.md
→ structured objects
→ publish
252. .txt 路徑
raw.txt
→ parse
→ structure candidate
→ review
→ canonical.md
→ structured objects
→ publish
253. Agent API 路徑
source
+ metadata
+ optional manifests
→ schema validation
→ canonical commit
254. 作者選 No-AI
deterministic-only
只要格式合法仍可發表。
255. 作者選 AI Assist
AI 可:
- 修格式;
- 恢復結構;
- 建議 metadata;
- 建議圖表;
- 找 rendering issue。
但 candidate patch 可見。
256. AI Assist 不等於 Auto-Author
如果只修格式:
不是 substantive authorship。
257. AI Assist Provenance
model
operation class
patch
accepted/rejected
保存。
258. 前後差異
diff 可查。
259. Author Acceptance
如果 semantic delta:
需要:
accepted_by
time
version
260. Render 後回報
warnings
degraded objects
artifact links
source hash
261. 發表後仍可下載 MD
非常重要。
讀者不只能拿 PDF。
262. Machine-readable Download
可以:
research.json
claims.jsonl
sources.jsonl
263. Public Source License
是否允許下載 / reuse 依 Paper 07 license。
264. Private Metadata
依 Paper 06 projection。
265. Render UI
讀者可切:
Read
Source
Claims
Evidence
Citations
Versions
Graph
Download
266. 人類不一定要看 Machine Layer
但想查就有。
267. AI 可以直接走 API
不用 parse page。
268. 這是真正的 AI-Native Website
不是:
網頁長得很像 AI。
而是:
269. 與 Paper 02 的接口
Research Classification:
PCRO metadata。
270. 與 Paper 03 的接口
Claim Card:
addressable claim object。
271. 與 Paper 04 的接口
citation / dataset:
source/evidence objects。
272. 與 Paper 05 的接口
author:
researcher ID object。
273. 與 Paper 06 的接口
render:
privacy projection。
274. 與 Paper 07 的接口
license / economic mode:
work metadata。
275. Paper 09 將加入 Adaptive Publishing
Paper 08 先建立:
Paper 09 再問:
parser / renderer 不夠好時,如何用 AI 補洞,又如何讓補洞經驗回流成 deterministic algorithm?
276. Paper 10 將加入 Account / Quota
AI preprocessing 有成本。
所以:
- login;
- account;
- quota;
- credit;
會在 Paper 10。
277. Source-Native Readiness Test
問:
若明天一個完全陌生 AI 上傳一份 UTF-8 Markdown,平台是否能在不要求 PDF 的情況下,保存原始 source、建立結構化 research object、驗證公式與 metadata、產生可重現 HTML/PDF、讓 AI 直接 query claim/evidence,且任何 renderer 或 preprocessing 都不能偷偷改寫作者原文?
如果可以:
278. Plain-Text Readiness Test
再問:
如果它只上傳一份乾淨但沒有 Markdown 標記的純文字,平台是否能產生可審核的結構候選,而不是把 AI interpretation 當作者原文?
如果也可以:
279. ASCS Readiness Test
再問:
當平台未來從 Markdown object extraction 升級成 EGIR / ASCS addressable symbolic objects 時,是否能保留原 author source 與 mapping provenance,而不推翻既有 work IDs、版本與 scholarly history?
如果也可以:
280. 結論
AI 原生學術文件不應再被理解成:
AI 幫人把 LaTeX 寫快一點。
那仍然只是讓 AI 更快進入舊 workflow。
真正的結構轉型是:
Unbounded Axiom 可以讓作者直接提交:
Markdown
或:
plain UTF-8 text.
不要求:
LaTeX document preparation
也不要求:
PDF generation.
數學仍可使用熟悉的:
$...$
與:
$$...$$
作 authoring syntax。
EveGlyph Editor 可以成為 authoring layer;EveGlyph Publication Runtime 可以成為可重現的 publication compiler;ASCS / EGIR 可以逐步成為更深層的 addressable semantic / computational object space;Unbounded Axiom 則保存 research identity、source、evidence、validation、versions 與 public projections。
因此最終關係不是:
而是:
本文最重要的修正則是:
作者正式確認的 UTF-8 source 是 authorial truth anchor。
平台正式確認的 structured research object 是 machine semantic anchor。
正式發布的 PDF / HTML 是 projection artifact anchor。
三者都有版本、有 hash、有 provenance,但沒有任何一層可以偷偷冒充另一層。
這樣才真正能同時保留:
- 人類可編輯性;
- AI 可理解性;
- source integrity;
- semantic structure;
- visual quality;
- interoperability;
- future migration。
也因此,下一篇真正的問題已經不是:
文件要用什麼格式?
而是:
當現實世界的文件永遠不完美、parser 永遠會遇到長尾、renderer 永遠會有 edge cases 時,AI 要怎麼作為補洞層,同時把每一次補洞變成下一版 deterministic system 的學習資料?
這就是:
Paper 09 — Failure-Driven Adaptive Publishing Pipeline
也就是本系列中「天選打工人 AI」正式登場的一篇。
參考資料
NISO. ANSI/NISO Z39.96-2024, JATS: Journal Article Tag Suite, version 1.4. Published October 31, 2024. DOI: 10.3789/ansi.niso.z39.96-2024.
https://www.niso.org/publications/z3996-2024-jatsNISO. Standardized Markup for Journal Articles: Journal Article Tag Suite (JATS).
https://www.niso.org/standards-committees/jatsW3C Math Working Group. MathML Core. Candidate Recommendation Snapshot, June 24, 2025.
https://www.w3.org/TR/mathml-core/CommonMark. CommonMark Specification.
https://spec.commonmark.org/W3C. HTML Standard / Web Platform specifications.
https://html.spec.whatwg.org/W3C. Scalable Vector Graphics (SVG) 2.
https://www.w3.org/TR/SVG2/EveMissLab. EveGlyph MCP Publication Runtime Technical Whitepaper v0.1. 2026-08-26.
EveMissLab. EveGlyph Computational Canvas Runtime Architecture (TW-03) v0.1. 2026.
EveMissLab. Current EveGlyph Editor → v0.8 Interchange Map. 2026.
EveMissLab. 從線性文件到可定址符號計算空間:EveGlyph ASCS 統合論文 v0.1. 2026.
EveMissLab. EveGlyph V1.0 Roadmap. 2026.
Neo.K, Aletheia / GPT-5.6 Sol. 從個人理論語料庫到 AI 原生預印本公共設施:Unbounded Axiom 的第二次相變. AI-Native Preprint Commons Series, Paper 01, 2026-09-03.
Neo.K, Aletheia / GPT-5.6 Sol. 引用不是裝飾:AI 原生 Source Reality、Citation Validation 與 Data Provenance. AI-Native Preprint Commons Series, Paper 04, 2026-09-03.
Neo.K, Aletheia / GPT-5.6 Sol. 研究可驗證不代表研究者必須透明:AI 研究者隱私、揭露狀態與可重現性邊界. AI-Native Preprint Commons Series, Paper 06, 2026-09-03.
版本紀錄
| 版本 | 日期 | 說明 |
|---|---|---|
| v0.1 | 2026-09-03 | 建立 SNSDA;區分 Author Canonical Source、Platform Canonical Research Object 與 Rendered Projection;確立 Markdown/TXT submission、raw-source preservation、semantic-delta gate、EveGlyph Editor / Publication Runtime / ASCS 分層、LaTeX math 與 LaTeX document workflow 分離、JATS/MathML/PDF/HTML/SVG adapter、render provenance、projection fidelity 與 source-native readiness tests。 |